Il Museo di Anatomia Patologica possiede una raccolta di esemplari anatomici che documentano le più diverse malattie dell'uomo. Il Museo dispone attualmente di un’ampia raccolta di campioni anatomopatologici, di provenienza autoptica e chirurgica. La casistica più completa e interessante è quella di Patologia Cardiovascolare, ricca – tra l’altro – di circa 900 cardiopatie congenite in storia naturale.